Основание Дубенского монастыря. ГБЛ, ф. 304/Ш, № 21 (М. 8663), л. 249. Из Четвероевангелия Преподобного Никона, «Вруцелето». ГБЛ, ф. 304/Ш, л. 192 об. Сказание о кончине Преподобного Никона и явлении Преподобного Сергия. ГБЛ, ф 304/Ш, № 21, (М. 8663), л. 294 об.— 295.

1494 – Скончался инок Амвросий, знаменитый резчик, казначей монастыря с 1490 по 1494 год. 1495—1505—Игуменом монастыря был святой Серапион, впоследствии архиепископ Новгородский. Погребен в Сераиионовой палате, на месте келлии Преподобного Сергия. 1512 — Поставлены каменные Святые врата и над ними церковь во имя Преподобного Сергия с приделом во имя святого Василия, епископа Парийского: церковь освящена 15 декабря 1513 года епископом Коломенским Митрофаном. 1525—1527—Игуменом монастыря был Преподобный Арсений Комельский. 1529—1539—Годы игуменства святого Иоасафа, впоследствии Митрополита Московского. 1547—На Московском Соборе установлено повсеместное празднование памяти Преподобного Никона, ученика и преемника Преподобного Сергия. 1548 — Поставлена белокаменная церковь над гробом Преподобного Никона. 1550 — Построены каменные стены монастыря (начало положено 12 марта 1540 года по просьбе игумена Порфи-рия). В середине XVII века стены были расширены и надстроены. Имеют башни: Пятницкую (1640), Житничью (перестроена в 1650 году), Красную воротную (XVI — XVII), Сушильную (XVI — XVII), Уточью (XVII), Звонковую (XVI —XVII). Каличью (перестроена в 1651 и 1758 — 1771), Плотничную (XVII), Келарскую (1642—1849), Пивную (XVI — XVII), Водяную (XVII), Луковую (XVI — XVIII); Соляная башня разобрана.

Интерьер Серапионовой палаты. XVI в. Фелонь Преподобного Никона. ЗГИХМЗ № 3199. Из Четвероевангелия Преподобного Никона. ГБЛ, ф. 304/Ш, л. 186 об.—187.

Благословение на подвиг безмолвия Преподобного Исаакия Молчальника. ГБЛ, ф. 304/Ш, № 21 (М. 8663), л. 211.

Запрестольный крест работы Преподобного Амвросия, Троицкого резчика. Оборотная сторона. ЗГИХМЗ, № 2389.

Покров с гробницы Преподобного Никона. ЗГИХМЗ, № 2418.

Колокол Никона Чудотворца.

В XVI веке в монастыре были построены здания, которые получили окончательное архитектурное завершение в последующих веках: Предте-ченский корпус келлий (XVI — XVII), Митрополичьи покои (XVI—XVIII), Инспекторский корпус келлий (XVI — XIX), Успенский корпус келлий (XVI — XIX), Казначейский корпус келлий (XVI — XIX), Экономский корпус келлий (XVI — XIX), Варва-ринский корпус келлий (XVI — XX). 1551—Игуменом монастыря был старец Артемий Пустынник. Его литературная деятельность в Московский период, а также в Литве, Белоруссии и на Украине имела большое историческое значение.

1551 — 1556—Годы жизни в монастыре ученого-монаха Преподобного Максима Грека.

1559—Заложен собор Успения Пресвятой Богородицы

1561—По благословению святителя Макария, Митрополита Московского и всея Руси, игумен монастыря Елев-ферий соборным определением 6 января возведен в сан архимандрита. Этот сан усвоялся последующим настоятелям Троицкого монастыря с первенством пред всеми прочими архимандритами других монастырей.

1564 — В ночь с 25 на 26 сентября возник сильный пожар.

1585—14 августа совершено переложение мощей Преподобного Сергия в новую серебряную раку и установлено особое празднество в Троицком соборе. — 15 августа митрополит Дионисий освятил Успенский собор (строительство длилось с 1559 года). Одновременно освящены два придела: во имя великомученика Феодора Стратилата и мученицы Ирины.

1586 — 8 июля монастырь посетил Антиохийский Патриарх Иоаким VI.

1589 — 5—10 февраля монастырь посетил Константинопольский Патриарх Иеремия.

1591 — Монастырь посетил Митрополит Болгарский Дионисий Палеолог.

1600 — Борисом Федоровичем Годуновым обложен золотом и драгоценными камнями храмовый образ Живоначальной Троицы.

1605 — 1610 — Годы настоятельства священномученика Иоасафа Боровского.

1606 — В монастырь перенесены и погребены близ Успенского собора тела Бориса Годунова, его жены Марии, сына их Федора Борисовича и дочери Ксении Борисовны.

1608 — 23 сентября началась осада монастыря войсками польско-литовских интервентов под руководством Сапе-ги и Лисовского.

1609 — 9 мая, во время осады Лавры, освящен в Успенском соборе северный придел — во имя Святителя Николая.

1610 — 1633 — Годы игуменства Преподобного Дионисия Радонежского.

1610 — 12 января осада войск Сапеги и Лисовского с монастыря была снята.

1611 — Монастырь стал центром национального освободительного движения против польско-литовских интервентов.

1612 — С 14 по 18 августа в монастыре молились князь Димитрий Михайлович Пожарский и Косма Минин, шедшие с отрядом освобождать Москву. Преподобный Дионисий благословил войско на защиту Отечества.

Южная стена Троице-Сергиевой Лавры. XVI— XVII вв.

Собор Успения Пресвятой Богородицы. 1559— 1585 годы. Колокольня. 1740—1770 гг.

1618 — 1 декабря заключено перемирие между Московским государством и Польшей в селе Деулино, где был построен храм во имя Преподобного Сергия.

1619 — Монастырь посетил Иерусалимский Патриарх Феофан, который возложил на Преподобного Дионисия свой клобук в знак уважения к заслугам игумена в борьбе с захватчиками, а также в знак признания дела исправления книг.

1621 — При монастырской трапезной построена церковь во имя Преподобного Михаила Малеина.

1623 — Преподобный Дионисий перестроил храм во имя Преподобного Никона Радонежского.

1626 — Приложены Михаилом Федоровичем три золотые цаты к иконе Святой Троицы.

1628 — Возник пожар.

1635 — По завещанию боярина Богдана Михайловича Нагого артелью местных мастеров вновь расписан Троицкий собор, в котором, как предполагается, сохранены композиции фресок Преподобного Андрея Рублева и Преподобного Даниила Черного.

1635—1638 — Построены больничные палаты с церковью в честь преподобных Зосимы и Савватия Соловецких.